宫外孕是有可能会出现阴道流咖啡色分泌物的。咖啡色分泌物也就是少量的血性分泌物。在宫外孕的早期会出现下腹部的隐痛以及阴道有少量血性分泌物的情况。所以，女性在早期妊娠的期间，如果还不能确认是否宫内怀孕，如果出现了有下腹部的隐痛以及阴道有咖啡色分泌物的情况，都需要及时就诊来排除宫外孕。

排除宫外孕的方法主要是通过超声来进行检查，超声如果在宫腔内没有看到妊娠囊，或者已经在附件区可以看到有不明原因的包块都有可能是宫外孕的情况，也可以通过人绒毛膜促性腺激素水平的监测来判断是否是宫外孕。

总之，宫外孕是会出现有咖啡色分泌物的，但是还需要与先兆流产等早孕期间阴道出血的情况来进行鉴别。