精囊的囊肿有可能是由于本身的体质因素，免疫能力下降，或者是遗传因素导致。另外和生殖泌尿系统的慢性炎症，比如前列腺炎、精囊炎、膀胱炎、尿道炎等，以及过度的性行为，手淫、缺乏运动都有直接关系。具体的病因并不是十分明确的。

一旦确诊是精囊囊肿影响正常的性生活，临床上最直接的治疗方法就是直接去医院采取手术切除囊性结构。术后是可以完全恢复正常生理功能的。