精子畸形率高会影响受孕能力，继而引起不孕不育。引起精子畸形率高的原因比较多，比如泌尿生殖道感染、先天性睾丸发育不全、附睾结核、腮腺炎合并睾丸炎、慢性精索静脉曲张等均可导致精子异常的发生。

男性生活习惯不好，比如长时间熬夜、工作压力大，饮食习惯、长时间久坐或者洗桑拿、吸烟、饮酒等，都会造成男性精子畸形。此外还有长时间使用激素类药物或某些化学药物，可使精子未成熟，形成异常精子，导致精子畸形率高。