1.反流屏障被破坏，首先可能是食管和胃部连接处出现明显反流所造成，此处的静息压也会直接构成一个压力的屏障是生理的作用，比如在腹内压逐渐增加时也会导致反流性食管囊肿。

2.上皮前因素，食管黏膜本身就具备抗反流的能力，但是在正常的情况下也同样可能会造成反流性食管的疾病，最终也会形成反流性食管囊肿。

如果胃部酸性物质出现明显反流时自然也会造成肠胃多次的蠕动，所以也会出现明显的异常反应这些都是当前比较常见的原因。