射精时腰痛，多考虑可能是性生活的过程当中腰部活动比较剧烈，再加上性生活的次数过于频繁，每次性生活的时间相对较长，就容易造成腰肌筋膜产生炎症反应，进而引起射精时出现腰痛症状。

也可能是由于本身存在泌尿系统感染性疾病所引起。常见于尿道炎、膀胱炎、前列腺炎等泌尿系统炎症。也可见于膀胱结石、尿道结石等泌尿系统结石，都可导致患者在射精时出现腰部疼痛症状。

另外，也可能是由于射精时对局部神经产生刺激而引起的腰痛。常见于存在坐骨神经痛、腰椎间盘突出等病史的人，在性生活过程中剧烈活动就会引起明显的腰痛症状。