萎缩性咽炎和干燥症在病因、症状，以及治疗上都是有区别的。

在病因上，萎缩性咽炎的病因还不是特别明确，可能与感染、鼻炎、长期接触刺激性气体或者粉尘、内分泌，以及免疫系统的疾病、营养不良、吸烟等因素有关。干燥症是一种自身免疫病，干燥症有可能是萎缩性咽炎的原发病因。

在症状上，萎缩性咽炎主要表现为咽干、咽部异物感、咳嗽等。干燥症主要为口、眼等部位的干燥。

在治疗上，萎缩性咽炎主要是对原发病以及对症治疗。干燥症主要是用促进腺体分泌、免疫调控等药物进行治疗。