钩端螺旋体病的肾损害，是多种多样的。外观上可以看到肾肿大，病理表现上可以看到肾小管上皮细胞变性、坏死、间质水肿。可见单核细胞，淋巴细胞浸润和小出血，间质性肾炎是钩体病肾脏的基本病变。

钩端螺旋体病的肾损害，较轻的只有少量蛋白尿、镜下血尿、少量白细胞和管型。重者出现肾衰竭，表现为少尿、大量蛋白尿和肉眼血尿，电解质紊乱、氮质血症与尿毒症。

肾衰竭是黄疸出血型常见的死亡原因，死亡病例的占60%到70%。各型钩体病都可有不同程度的肾损害的表现。