异尖线虫病在潜伏期内对人体有影响。

寄生虫进入人体后，主要寄生于人体的消化道各个部位，幼虫也可以引起内脏移行症。虫体主要是钻入胃肠壁内寄生，这个过程会导致胃肠道粘膜的受损，包括水肿、出血、糜烂、溃疡，移行到各脏器，也会对脏器造成损伤。

发病后主要表现为胃肠道的症状，轻症的患者有轻度的胃肠道不适感，重症的病人会出现突发的腹痛，伴有恶心、呕吐、腹泻，因症状酷似急腹症，常常被误诊。