磁共振检查和ct检查都属于影像学检查的范畴，两者有不同的地方，也有相同的地方。

不同之处是，ct是利用X线检查，磁共振是利用原子素发出核磁共振的一个原理进行检查。相同的地方，两者都是利用计算机重建原理所得到了一个断层图像，两者都抛弃了前后重叠的影响。但是由于两者成像原理的不同，所以两者对各种疾病的显示是不一样的，对于疾病的诊断也是不一样的，但是又不能一种完全替代一种。两者的检查是可以互补的，甚至是密不可分的。

所以并不能说哪个更清楚，有时候往往会做了ct再做磁共振，有时候会做了磁共振再去做ct，这样的情况，在临床上是大有存在的。对于某些疾病的诊断，可能要结合ct和磁共振的检查，共同考虑。