12岁孩子发烧39℃，应当使用退烧药物降低体温，并且配合进行物理治疗。

12岁孩子体温高达39℃，表明处于高烧的状态，应当及时地给孩子口服一些退烧药物，比如布洛芬，避免温度持续增高。小儿用药时一定要注意用药量以及用药的间隔时间，也要多给小孩喝温开水，让小儿多休息，避免过度活动。

如果反复出现高热的情况，可能是存在病毒或者是细菌感染，应当及时带孩子就医进行相应的检查，明确感染的类型，进行针对性治疗。在治疗过程当中也要加强护理，注意身体保暖。