首先要配置灌肠液及灌肠液的温度，连接好灌肠器的各部分部件，将灌肠液放到高处，自己取舒适的体位，在导管及肛门口涂抹润滑剂，将肛管插入肛门约10到15公分，将灌肠器的开关打开，就可以开始灌肠。

灌肠是一种非比较常规的治疗手段，部分疾病通过灌肠治疗，取得很好的用药效果。灌肠通常需要专业的医护人员进行操作。

但像溃疡性的结直肠炎等疾病，治疗周期非常长，患者需要自己学会灌肠治疗，要学会灌肠液的配置以及灌肠器的连接，向肛门插导管时，切勿使用蛮力，防止损伤肛门直肠组织。