毛囊炎和疱疹可以通过皮肤表面的形态以及实验室检查方面来进行区分。

毛囊炎主要是因为感染细菌而导致，皮肤表面会形成一些突起于皮肤的炎性丘疹，外观呈红色或者是暗红色，伴随着按压性疼痛。而疱疹则主要是因为某些病原体感染人体或者是某些自身免疫性疾病作用于人体，而引发的一种水疱或者脓疱。外观一般不会因为某些因素刺激而出现明显的疼痛，而且刺激之后比较容易破裂。

而实验室检查方面，毛囊炎一般检查病毒查不出来。而疱疹则需要根据相关的形态进行相关的疱疹病毒检测，比如单纯疱疹病毒筛查或者是水痘-带状疱疹病毒培养，然后就能够进行明确的诊断。