微创碎石只要操作得当，一般不会对肾造成太大的伤害。

如果操作不当就有可能对肾脏造成一定的伤害，比如在进行体外冲击波碎石时，如果能量过大或者是进行了二次碎石，并且碎石的间隔时间较短，就有可能会对肾造成一定的损伤。如果进行的是经皮肾镜碎石取石术，在碎石时操作不当有可能会导致肾出血，将会影响到肾功能。

因此，在进行碎石手术时一定要严格操作，避免造成不良影响。在碎石后也要注意观察是否存在肾脏损伤的情况，如果存在肾脏出血应及时地进行治疗。