精子染色体异常通常是不能够治疗的，因为精子染色体异常多半是遗传因素引起的，无论是药物治疗还是手术的方法，都不能改变精子染色体异常现象。

精子染色体异常还与经常处于存在放射性物质的环境，影响精子正常发育有关。

一旦患有精子染色体异常是会影响到人正常生育的，所以建议患者可以通过试管婴儿的方法进行移植前选择正常的胚胎，怀孕后生育，从而达到生育健康下一代的目的。