口服药物也是治疗孩子矮小症众多措施中的一种，其方式主要是针对原发病进行用药，比如由甲状腺引起的矮小症，需要口服甲状腺素进行治疗。如果孩子矮小与营养不良有关，需要补充足够营养类物质进行治疗。

口服药物对于矮小症的治疗存在一定局限性，大多矮小症的患儿需要注射生长激素进行治疗。特别对于侏儒症、性早熟以及生长激素缺乏引发的矮小症，该治疗方式存在异议。

另外，如果孩子矮小症是由肿瘤疾病所引起，如垂体瘤等，在进行生长激素注射的同时，还要应用手术措施进行治疗。术后应做好护理措施，并定期复查。