因为偏头痛的发病原因目前尚不十分明确，有血管因素参与，也有神经因素参与，近年来认为偏头痛是一种脑功能性疾病。最新的头痛分类分类标准把偏头痛分为无先兆偏头痛、有先兆偏头痛、慢性偏头痛以及偏头痛并发症等。

目前偏头痛尚缺乏特异性的诊断手段，辅助检查的目的是为了排除继发性头痛或了解偏头痛患者合并的其他疾病。

1.血液检查：主要用于排除颅内或系统性感染、结缔组织疾病、内环境紊乱、遗传代谢类疾病等引起的头痛。

2.经颅多普勒超声：经颅多普勒在偏头痛发作时可以观察到血流速度增快或减慢、血流速度不稳定、血流速度两侧不对称等种种表现。

3.腰椎穿刺：腰椎穿刺主要用于排除蛛网膜下腔出血、颅内感染和脑膜癌病及异常颅压引起的头痛。

4.CT和MRI检查：CT和MRI检查是了解头痛是否源于颅内器质性病变的主要手段。CT在急性颅内出血、脑外伤、颅骨病变方面有优势，MRI则在后颅窝及颅颈交界病变、垂体病变、脑白质病变、缺血性病变、静脉窦血栓形成、动静脉畸形、硬膜外及硬膜下血肿、肿瘤、脑膜病变、颅内炎症、脑脓肿等方面更胜一筹。疑有静脉窦血栓时还应行DSA检查或MRV检查。