生长激素治疗有临床意义的副作用是比较罕见的，可能发生的包括良性颅内压增高、青春期巨乳症、关节痛和水肿，而这些需要仔细询问患者的病史，对患者做仔细的体格检查，以确定这些副作用是不是跟药物有关。

处理副作用主要包括，暂时减少生长激素的剂量或者暂时停用生长激素。在没有其它风险因素的情况下，目前，没有证据表明长期使用生长激素治疗的患者，白血病、脑肿瘤复发、糖尿病的发生风险会增加。

肿瘤幸存者在进行生长激素治疗时，应该同时请神经外科的大夫进行多学科的会诊。