要通过三个方面控制深部真菌感染病情加重：

第一，要明确真菌感染的部位和具体的病原菌，明确诊断后可以选择敏感的抗真菌的药物治疗，可以更加有效的控制真菌的感染，真菌治疗的周期要适当延长。

第二，要对患者的基础疾病进行有效的治疗，真菌感染多发生在免疫力低下、长期使用激素、抗生素的患者，有些患者可能有糖尿病，要对诱发真菌感染的诱因或基础疾病进行治疗，有利于真菌感染的控制。

第三，对症治疗，抗真菌的药物对肝功能损害很大，要注意监测肝功能对真菌感染的相关症状要及时进行治疗。