晚上醒来舌根苦有可能是胃火引起，另外跟胃肠消化功能不良也有关系，都有可能会导致舌根出现发苦。

1.胃火。在胃火比较大的情况下会导致胆汁淤积或者是胆汁反流，当胆汁反流到口腔当中后在晚上醒来后，舌根就会出现发苦，需要通过口服去火的药物治疗，比如可以选择使用双黄连口服液的药物治疗。

2.胃肠消化功能不良。胃肠消化功能不良主要会影响到食物在肠道当中的消化，如果食物在肠道当中长期没有消化，就有可能会导致反流到胃部当中，从而会导致晚上醒来后舌根出现发苦，可以通过使用奥美拉唑的药物改善。

晚上醒来舌根苦跟患有肝胆疾病或者是饮食不当饮食有关系，必要时还需要到医院就诊。