菌血症和败血症的区别有性质、临床表现、治疗不同。具体如下：

1.性质不同，菌血症指的是血液中存在病原微生物；而败血症指的是致病菌在血液中生长繁殖，产生毒素，导致出现全身急性感染性疾病。

2.临床表现，菌血症患者突发高热或者是低温，病情急、重、快，还会有头晕、头痛，严重时意识丧失，还会有心动过速、脉搏细快、呼吸加快症状；败血症患者可能出现寒战、高热、皮肤起瘀点、关节疼痛，肝脏、脾脏肿大等。并且由于感染的细菌不同，出现的症状也有差别。

3.治疗，菌血症需要清除外置物，同时根据细菌培养选择用药；败血症需要立即进行药物治疗，然后根据药敏实验调整用药。