对于不同的症状，萆薢的替代药也可有不同。

首先，在治疗淋证方面的疾病，主要是膏淋时，可用海金沙代替。海金沙虽没有萆薢去浊的效果明显，但通过药物的配伍同样能达到利湿化浊的目的。其次，在治疗风湿性疾病时，主要为关节的疼痛，可用独活、秦艽、防己等具有祛风除湿功效的药物代替。

萆薢既能祛湿，又能除痹，在临床上经常被用于着痹的治疗，而大多数的祛风湿药对于筋骨关节的风湿痹痛都可以进行治疗。因此，此类药物也就多能代替萆薢。最后，药物虽好，但临床应用时仍需要谨慎，尽量避免发生不良反应。