脑型血吸虫可以对脑细胞造成直接的刺激，使患者的脑细胞出现炎症，患者可以表现为脑膜刺激的症状，表现为头痛，病情严重的患者可以伴有恶心、呕吐。

脑型血吸虫病呈局部的囊肿，对脑细胞造成直接的压迫，患者可以出现偏瘫的症状。局部的囊肿还可以导致脑细胞异常放电，使患者出现癫痫的症状，癫痫反复发作会导致患者出现永久性的损伤。

有些确实长的虫卵还可以堵塞脑血管，导致患者发生脑栓塞，脑型血吸虫可以通过多个方面导致脑组织发生损伤。