同房后第二天头疼的原因，大致包括以下几个方面：

1.考虑是因为同房后，身体过度疲劳，导致夜间睡眠质量不好。影响了大脑神经的正常生理功能，第二天表现出头疼症状。

2.考虑是因为平时血压不稳定。当同房后，导致血压增高，表现出第二天头疼症状。

3.考虑是因为平时患有神经衰弱病症。当同房后，由于大脑神经过度兴奋，会导致神经衰弱症状加重，出现上述不适症状。

因此，建议平时同房的时候，要根据具体身体情况，合理地调整同房时间，以免引起不适症状。