高血压的危害主要是造成组织器官的损伤，及靶器官的损害等。常见损害的器官是心脏、脑、肾脏及血管等的损害。

因为长期的高血压，可以引起高血压性心脏病，导致心功能的下降，出现舒张功能障碍。可以造成脑部血管的微动脉瘤形成，而引起脑出血的表现。也可以造成脑动脉的硬化，使管腔变窄而导致脑组织的缺血、缺氧，而形成短暂性脑缺血发作或者脑梗塞。

对肾脏的损害，可以造成肾动脉的硬化，导致慢性的肾功能不全，出现大量的蛋白尿，甚至严重发展成肾衰竭，出现尿毒症的表现。对眼部的损伤，引起眼底动脉的硬化，出现视力模糊等，也可以造成主动脉夹层的病变。