肛周脓肿手术之后，大部分是不会引起肛门的生理功能，因为肛周脓肿都只需要将脓液放出，然后进行清理就可以。

如果肛周脓肿持续的加重，甚至于已经到了深部进入了盆腔和肛门括约肌比较近，这时候就需要注意，可以先进行脓肿的清理，然后进行挂线治疗，这一种方法可以使肛门损伤降到最低，而且不容易出现肛门失禁。

所以，具体肛门脓肿会不会有并发症，主要看处理的程度以及患者的年龄以及恢复的程度。