肛周脓肿手术后并不都会发展成为肛瘘。

首先，肛周脓肿是一个笼统的概念，任何发生于肛门周围的化脓性感染都可以统称为肛周脓肿。而其中肛周疖肿等皮肤的化脓性感染，并不会发展成为肛瘘。而由肛腺感染所引发的肛管直肠周围脓肿，大多会发展成为肛瘘。

其次，和患者的手术方式也直接相关。如果患者行肛周脓肿一次性根治术，术中由于已经将内口切开，所以绝大多数术后不会发展成为肛瘘。但如果患者单纯行肛周脓肿切开引流术，术后约有80%的患者会发展成为肛瘘。