开颅手术后头疼主要是由于在开颅手术的过程当中，需要将头皮、肌肉切开，会导致头皮上的神经被切断，所以，在术后会出现头痛。

在开颅手术进行时需要对脑组织进行牵拉，当脑组织受到牵拉、刺激后，容易出现损伤而引起脑组织水肿，致使颅内压增高，当颅内压增高后，会对硬脑膜部位的神经造成刺激，进而引起头痛。此外，手术中可能会出现渗血，血液如果渗入到蛛网膜下腔，也会对硬脑膜上的神经产生刺激而引起头痛。

手术中造成的渗血一般可在2周左右逐渐吸收，手术引起的脑组织水肿通常也可在2周左右消退。因此，手术后患者头痛持续的时间通常为2周左右。