体内多种激素缺乏都可以导致孩子长不高，临床上最常见的就是生长激素缺乏，生长激素缺乏是由于垂体的病变导致的，比如垂体瘤，垂体瘤可以导致垂体分泌的生长激素减少。生长激素可以促进蛋白质的合成，促进骨骼的延伸，此激素缺乏就可以导致身体生长减慢。

甲状腺激素也可以影响身体的生长发育，所以甲状腺激素缺乏也可以导致患儿出现生长发育减慢，甲状腺激素还会影响智力的发育。

有些先天性疾病也可以导致孩子长不高，比如先天性维生素d的利用障碍，会影响软骨的发育，也会影响身高的发育。