原发性肝癌临床上主要分三期，也可以根据TNM标准，临床上分为四期。

三期的分期标准指没有明显肝癌症状和体征的属于一期，有明显的恶液质、全身皮肤黏膜黄疸、癌性腹腔积液、肝外转移证据这些情况之一时，则属于三期的肝癌。而介于两者之间则属于二期的肝癌。

而根据TNM分期标准，一期主要是肝脏的肿瘤没有血管受侵，并且没有淋巴结和远处转移。二期主要是肝脏的原发肿瘤有血管受侵或者是多发性的肿瘤，大的肿瘤大于5cm，并且没有淋巴结和远处转移。三期的肝癌则是指肿瘤的大小大于5cm，并且侵及到周围组织或者区域淋巴结时，但是没有远处的转移。而四期则是有远处转移的肝癌。