早期肝囊肿较小，症状不明显，患者多是在体检时发现。肝囊肿在不同的位置可引起不同的症状。如果在肝脏的实质中间，肝囊肿一般超过10公分以上才会有腹部不适，包括腹胀、腹痛、甚至引起肝功能改变等异常。

如果肝囊肿在边缘，没有压迫到胃肠道，囊肿在10公分以下，症状都不明显。如果囊肿偏大超过10公分或对胃肠造成压迫，可引起腹胀不适、腹痛等症状。单纯的肝囊肿在不引起症状的情况下，可定期观察。如果囊肿出现相应的并发症，则需手术治疗，手术方式包括囊肿的切除和囊肿的开创引流等。