喉囊肿鉴别诊断，喉内型气囊肿与喉囊肿鉴别较困难，但喉囊肿与喉室不通，其体积不随呼吸改变，压之不缩小。

从喉室突出的喉内型气囊肿须与喉室脱垂相鉴别，喉室脱垂多为喉室黏膜炎性水肿或肥厚，自喉室脱出，其特点是位置一定在喉室口处，可以器械推送回喉室内且是体积不随呼吸改变。

喉外型气囊肿必须与腮裂囊肿、甲状舌管囊肿、皮样囊肿等相鉴别，主要鉴别点为喉气囊肿时大时小、变化较快，用手挤压可缩小，而其它各种囊肿则无此特点。