虽然关节结核和肺结核都是由于结核杆菌感染造成，但是还是有一定区别。

首先就是侵袭的部位不同。肺结核是结核杆菌感染肺脏，造成肺组织的结构破坏，产生咳嗽、咳痰，甚至造成肺脏的结核空洞、咳血等严重的情况；关节结核是结核杆菌感染关节的结构，产生关节局部的化脓性炎症，导致出现肿胀、疼痛、功能障碍，甚至造成关节的变形、死骨形成、皮肤的破溃、流脓、窦道形成，迁延不愈。

再有就是肺结核在活动期是具有很强的传染性，关节结核一般不具有传染性。另外关节结核的感染途径最常见的是肺结核的菌栓经过血液循环，或者淋巴循环到达关节部位，产生的继发性的关节结核。