由于卵巢囊肿的具体类型不同，所以卵巢囊肿是否会在怀孕后消失，这就得根据具体的情况来判断。

比如女性是在怀孕前发现有卵巢的黄体囊肿，在怀孕以后可能不会消失。反而会因为体内激素的刺激导致囊肿一直存在，同时在怀孕期间可能会出现长大的表现。

但如果女性在怀孕前是有卵巢巧克力囊肿，而巧克力囊肿又特别小，在怀孕以后可能会出现巧克力囊肿自然萎缩消失的表现。所以对于很多巧克力囊肿的女性，在怀孕以后都会出现巧克力囊肿自愈的现象。