婴儿打疫苗后发烧39℃可以通过物理降温，及时补充水分，严重者遵医嘱口服药物。

1.物理降温。婴儿打疫苗之后有发烧的症状，很可能是疫苗所产生的不良反应，应该及时通过物理降温，用冷毛巾热敷婴儿的额头、手心以及脚心等部位，能达到物理散热的效果，可以帮助退烧。

2.及时补充水分。婴儿在发烧的过程当中，可能会导致体内的水分流失过多，应该适当喂一些白开水，可以为身体补充水分，防止体内液体丢失过多。

3.口服药物。持续发烧，通过物理治疗效果不好情况下，可以遵医嘱通过口服退烧药物缓解，比如布洛芬、对乙酰氨基酚等。