吞咽喉咙痛有以下原因：

1.发生在口咽部，临床上常见的疾病有急性咽喉炎、疱疹性咽峡炎、急性化脓性扁桃体炎、扁桃体周围炎、咽旁脓肿等相关的疾病，病变累及咽缩肌的时候，吞咽疼痛就非常明显。

2.疼痛发生在下咽部，临床上常见的疾病有急性会厌炎、喉癌晚期、下咽癌梨状窝型等相关的疾病。

3.如果吞咽时疼痛位置更深，出现在颈深部，这种情况有可能与食管的疾病有关系，比如有食道的炎症、食道的溃疡或者食道肿瘤，都可以出现吞咽疼痛的可能。