先天性再生障碍性贫血，可以考虑进行异基因造血干细胞移植。但是，骨髓配型比较困难，花费非常高，移植后也有可能会发生一些并发症。所以，临床上应用的并不是特别多。

发生先天性再生障碍性贫血时，病人有可能会出现多种贫血的表现，还有可能会发生感染、发热、出血等。通常情况下，需要加强对症支持治疗，根据病人的情况，酌情选择输血、输注血小板，或者是进行抗感染治疗等。

也可以按照医生的指导，使用肾上腺皮质激素类的药物或者是免疫抑制剂等进行治疗。对于先天性再生障碍性贫血，也可以起到一定的治疗效果。