病毒性食管炎的治疗方法，要根据引起此疾病的病毒类型来选择。

如果是巨细胞病毒性食管炎，则需要在医生的指导下，使用更昔洛韦等药物进行抗病毒治疗，治疗时间一般需要持续两周左右。巨细胞病毒性食管炎主要是由于患者免疫力低下，所以需要饮食均衡并进行适当的锻炼，来提高机体的免疫力。

如果是水痘疱疹病毒性食管炎或单纯疱疹病毒性食管炎，除了使用阿昔洛韦外，还需要配合使用促胃肠动力药。这样可以有效地抑制胃酸，避免出现胃黏膜损伤的情况，一般需要持续一周左右。