打哈欠的时候耳朵疼，可能是下列因素导致：

1.打哈欠的动作幅度过大或过于夸张，导致下颌关节的部位受到了拉伤，引发了疼痛，而疼痛感会放射至耳部。

2.咽喉炎。咽喉炎患者的咽喉黏膜有充血、肿胀、疼痛的表现。打哈欠的时候，因为动作会牵拉咽喉肌，就会导致黏膜的疼痛感产生且向耳朵部位蔓延。

3.腮腺炎。腮腺炎会导致患者一侧或双侧的脸部的皮肤及肌肉的肿胀、疼痛。打哈欠的时候直接牵动整个脸颊部位，就会导致脸颊连带耳朵部位的疼痛。