脑型疟疾和中毒型菌痢不一样。脑型疟疾的感染病原微生物为原虫，属于疟疾的重症感染类型，其临床症状以全身症状和神经系统特异性症状为主。

中毒型菌痢为细菌感染性疾病，其临床症状首先出现消化道症状，随病程演变，可引起全身感染严重症状，可合并严重神经系统损伤症状。

在化验检查方面，脑型疟疾以血液涂片为主，如血涂片检查当中可明确发现疟原虫，可明确诊断。中毒型菌痢以血常规、粪便常规，以及病原微生物培养检查为主。