急性脊髓炎会影响内脏功能，但不会损伤内脏结构。急性脊髓炎可出现自主性症状，急性期尿潴留或便秘，脊髓休克期逐渐失禁，部分病例最终成为自主性膀胱。

其它的自主神经功能障碍可能会发生在不同的受损节段，如霍纳综合征、血管运动异常、汗液分泌和营养障碍以及内脏功能障碍。

脊髓炎会导致脊髓水肿，导致继发性不完全性截瘫。脊髓长期缺血出现痉挛、束带、疼痛、排便功能障碍，使脊髓软化、萎缩。