早上起床口臭的原因，概括如下：

1.晚上睡觉前没有刷牙或者漱口，之前的食物残渣在口腔内存留的时间过长，导致细菌生长而引起的口臭。

2.患有口腔的疾病，比如口腔溃疡、龋齿、牙龈炎等，患病后口腔内容易滋生厌氧菌，会分解出硫化物而引起口臭。

3肠胃疾病引起，比如胃溃疡、反流性胃炎、消化不良等，会有明显的口臭。

4.如果感染了幽门螺杆菌，需要做碳13呼气试验进行诊断。