新生儿肺炎合并有二型呼吸衰竭的情况下，还是挺严重的。

二型呼吸衰竭说明患儿已经有了低氧血症和高碳酸血症，所以临床上的表现有呼吸困难，即使在安静状态下，呼吸频率都超过了60次/分或者是呼吸低于30次/分，呼吸节律发生了改变甚至是暂停，三凹征明显，吸气有呻吟声，患儿还会出现青紫、精神状态差、反应差、肌张力低下，心率下降，小于100次/分、四肢末端发凉等。

需要积极治疗肺炎这个原发疾病，这是最根本的治疗，并且要加强治疗的力度，采取保暖措施以及支持疗法，并对症处理其他的问题。