孕后期肛门有肉脱出疼，首先就是考虑内痔部分发生了脱出。在还纳不及时的情况下，发生了水肿或者是有血栓的形成。在怀孕后期由于腹盆腔压力较大，可能会导致肛管位置的压力增加，进而容易导致内痔发生脱出。

另外，在怀孕后期，由于行动不便、活动减少、胃肠功能减弱，在饮食上过于油腻的情况下就比较容易出现大便干燥情况。

排便的时候过度用力、用时过长，也会导致肛门有肉发出、脱出并且会伴有疼痛症状。在出现症状之后，主要就是以药物对症治疗为主。