通常脑神经检查包括脑电图、头颅CT或头颅核磁共振以及脑脊液检查。

脑电图有利于发现脑部功能是否异常，尤其在癫痫患者常可发现癫痫波，通常表现为棘波或尖波。影像学包括头颅CT及头颅核磁，各有优缺点，头颅CT观察脑出血、钙化优于头颅核磁共振，而头颅核磁观察脑梗死、脑部肿瘤以及动脉畸形等则优于头颅CT。脑脊液的检查通常用于明确各型脑炎以及脱髓鞘病变、蛛网膜下腔出血等。

除了上述检查，目前临床上采用功能核磁和CTP等更先进的检查，都在脑神经的检查中发挥其作用。