脑血栓和脑梗塞的区别在于两者的发病原因不同。脑梗塞包括脑血栓，脑血栓是脑梗塞一种类型。

引起脑血栓主要的病因为高血压、糖尿病、高脂血症、高同型半胱氨酸血症，临床上也称为动脉粥样硬化血栓性脑梗塞。脑梗塞发病原因比较广泛，根据发病原因不同，可以分为脑血栓、腔隙性脑梗塞、脑分水岭梗塞、脑栓塞。

脑分水岭梗塞主要的病因为低血压和低血容量。脑栓塞主要的病因为心房内的附壁血栓脱落和大动脉粥样硬化斑块脱落。