引起呼吸衰竭的原发疾病有以下几大类：

首先是呼吸道的病变，通常是指上、下呼吸道的任何疾病均可引起气道的阻塞，从而造成气道的通气功能不足出现呼吸衰竭，例如喉水肿、喉癌以及支气管异物等。

肺组织病变，通常是指弥漫性的肺实质病变，例如重症肺炎、肺气肿、间质性的肺病、肺纤维、矽肺等。还有某些气胸、大量胸腔积液也可以引起不同程度呼吸衰竭。

神经肌肉病变，通常是指那些脑炎、脑外伤、脊髓灰质炎、多发性的神经炎等；引起急性肺水肿的病变通常是指心力衰竭、急性呼吸窘迫综合征；肺血管病变主要是指肺栓塞、肺血管炎等；胸廓病变多见于严重的胸廓畸形、胸廓外伤、肺挫伤、手术创伤等。