轻微的脑积水通常非手术疗法进行治疗，严重的脑积水才可采取手术疗法，大多愈后良好。

如果脑积水发展缓慢，积水量少，症状不太严重，应当采取非手术疗法，使用药物抑制脑积液的分泌，比如应用醋氮酰胺。如果非手术疗法治疗效果不佳，症状持续加重积水较多，可考虑手术疗法。

不同类型的脑积水，手术疗法也不一样。如果是慢性梗阻性的脑积水，应当先将梗阻去除，切除颅内的占位性病变。如果梗阻不能消失，可使用脑室腹腔的分流术。引起急性梗阻性的脑积水，应当采用脑室引流，解除梗阻。