肛瘘瘘管流脓会导致肛门瘙痒。

首先，肛瘘瘘管流脓会导致肛门周围潮湿，局部容易以细菌增生，并且并发感染，脓液的刺激以及局部感染均可能引发肛门瘙痒。

其次，肛瘘瘘管流脓导致的肛门潮湿，可能会引发肛周湿疹，也会导致肛周瘙痒的症状。

所以，在临床上肛瘘患者不仅会出现反复肛门肿痛以及流脓症状，病史比较久的肛瘘患者还会伴有肛门周围潮湿和瘙痒。

肛瘘只有通过手术治疗才能治愈，所以为了避免这些并发症状，患者应及时去医院行手术治疗治愈肛瘘。平时应该注意肛门部清洁卫生，保持肛门部干燥。