原发性IgA病应当与以下疾病进行鉴别。

一、过敏性紫癜性肾炎，紫癜性肾炎与IgA肾病在肾脏病理方面非常相似，但是过敏性紫癜性肾炎常常有典型的过敏症状的发生，比如患者会出现皮肤紫癜、关节肿痛、胃肠道反应、黑便，这些临床症状有利于与原发性IgA肾病鉴别。

二、薄基底膜肾病，通常表现为持续性镜下血尿，常常有血尿家族史，肾脏免疫病理检查提示IgA阴性，而电镜检查会发现弥漫性肾小球基底膜变薄。

三，急性肾小球肾炎，通常急性肾小球肾炎往往在前驱感染发生以后，潜伏期较长，有自愈倾向，而原发性IgA肾病潜伏期较短，病情反复发作，通常急性肾小球肾炎会出现C3下降，ASO升高，而原发性IgA肾病会出现血清IgA增高，这些实验室检查有利于两者之间的鉴别。

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