胆管癌如果不能够进行手术治疗，往往需要采用全身化疗的方式控制病变的发展。

在临床上吉西他滨、顺铂、草酸铂、氟尿嘧啶、卡培他滨等药物都可以用于胆管癌的化疗。这些药物往往是2~3种组成联合的化疗方案，共同杀灭胆管癌的细胞。如果胆管癌还处在相对早期的阶段，没有发生远处器官转移，必要的时候可以进行局部的放射治疗。

而放疗和全身化疗的综合应用，对于进一步改善治疗的疗效、延缓病人治疗后复发的现象非常有益。近年来随着精准医学的发展，在一些临床研究当中靶向治疗和免疫治疗药物，也逐步地应用到胆管的治疗当中，并取得一定的疗效。